NGS data analysis: basic QC Константин Оконечников

Uploaded By: Myvideo

Published on

25 May 2015

33 views

0

0 votes

0

About Share Download Add to

Константин Оконечников, Max Planck Institute for Infection Biology Слайды: During the seminar participants will be challenged to apply programming skills to perform basic quality control of next generation sequencing dataset. The following concepts will be explained: BAM/SAM format, pysam and pyplot libraries, coverage, GC-content. Examples of practical tasks will include: • GC-content computation • Duplication rate

Share with your friends

Link:

Embed:

<iframe width="640" height="360" src="//myvideo.cc/embed/VjFmYU1wWTVkUHk4Y3hrRkZiVmRHMTUwTkdsRy9Xcm4rYWdSWDNjNzExcz0" frameborder="0" webkitallowfullscreen mozallowfullscreen allowfullscreen></iframe>

Video Size:

Custom size:

x

Autoplay video

Hide player controls

Hide resume playing

Add to Playlist:

Favorites

My Playlist

Watch Later

Andrew Ng's ENTIRE Intro AI Course in 25 minutes

9 months ago

00:24:32

Andrew Ng's ENTIRE Intro AI Course in 25 minutes

0 6%

DESeq2 Basics Explained | Differential Gene Expression Analysis | Bioinformatics 101

2 years ago

00:25:32

DESeq2 Basics Explained | Differential Gene Expression Analysis | Bioinformatics 101

0 87%

Логистические инвестпроекты. Шерегеш станет городом. Блокировка счетов на Кипре. Кто скупает Грузию

2 years ago

00:23:13

Логистические инвестпроекты. Шерегеш станет городом. Блокировка счетов на Кипре. Кто скупает Грузию

2 61%

Rethinking Connectivity Derek Collison GOTO 2022

2 years ago

00:48:12

Rethinking Connectivity Derek Collison GOTO 2022

0 76%

Andrew Ngs Machine Learning Specialization 2022 | What is it and is it worth taking

3 years ago

00:12:07

Andrew Ngs Machine Learning Specialization 2022 | What is it and is it worth taking

5 26%

Andrew Ng's New Machine Learning Specialization is Out!!!

3 years ago

00:09:44

Andrew Ng's New Machine Learning Specialization is Out!!!

2 5%

Andrew Ng's New Machine Learning Course 2022! Hit Or Miss

3 years ago

00:13:12

Andrew Ng's New Machine Learning Course 2022! Hit Or Miss

16 72%

Принципы анализа данных NGS | Юрий Барбитов, Институт биоинформатики

4 years ago

01:31:14

Принципы анализа данных NGS | Юрий Барбитов, Институт биоинформатики

1 95%

WhySeq When You Can nCounter

4 years ago

00:01:38

WhySeq When You Can nCounter

3 16%

Season 2 Ep. 1 Sergey Levine explains the challenges of real world robotics

4 years ago

00:59:18

Season 2 Ep. 1 Sergey Levine explains the challenges of real world robotics

0 15%

Человек-паук 3: Нет пути домой Русский тизер-трейлер (2021)

4 years ago

00:03:09

Человек-паук 3: Нет пути домой Русский тизер-трейлер (2021)

4 48%

DJ NG feat. Katy B & MC Versatile - TELL ME

4 years ago

00:04:51

DJ NG feat. Katy B & MC Versatile - TELL ME

2 7%

How to jump into Data Science

4 years ago

01:10:00

How to jump into Data Science

3 68%

Коносуба ➤ 3 Сезон Дата выхода | И почему же задержали 3 сезон

6 years ago

00:05:08

Коносуба ➤ 3 Сезон Дата выхода | И почему же задержали 3 сезон

0 31%

Unipro UGENE podcast #55: What's new in UGENE & - Part 2. NGS data quality control

6 years ago

00:08:13

Unipro UGENE podcast #55: What's new in UGENE & - Part 2. NGS data quality control

14 76%

NGS lecture 9

6 years ago

00:50:47

NGS lecture 9

26 20%

САММИТ NANOSTRING - часть 3-я.

6 years ago

01:30:07

САММИТ NANOSTRING - часть 3-я.

0 38%

Хрусталь Русский трейлер (2018)

7 years ago

00:01:20

Хрусталь Русский трейлер (2018)

28 13%

Zenome NGS 2018, Moscow

7 years ago

00:11:11

Zenome NGS 2018, Moscow

0 64%

УЗ Промышленный район Николаева / НГЗ, Жовтневая, Прибугская

7 years ago

00:54:17

УЗ Промышленный район Николаева / НГЗ, Жовтневая, Прибугская

12 12%

Шоу у театра Красный факел 17 сентября

7 years ago

00:01:38

Шоу у театра Красный факел 17 сентября

3 24%

Коллоквиум: Методы машинного обучения и большие данные биоинформатики

8 years ago

01:38:47

Коллоквиум: Методы машинного обучения и большие данные биоинформатики

19 44%

Sharing of bioinformatics data with UGENE

9 years ago

00:02:49

Sharing of bioinformatics data with UGENE

1 17%

NGS data analysis: basic QC Константин Оконечников

10 years ago

00:30:43

NGS data analysis: basic QC Константин Оконечников

33 41%

0 Comments

Guest