Применение методов deep learning к задаче эпитопного картирования

При разработке лекарственных препаратов на основе терапевтических антител возникают различные задачи, связанные со структурами антитела и/или антигена. Например, к ним относятся фолдинг (определение структуры по последовательности), докинг (определение комплекса антитело-антиген), эпитопное картирование (определение эпитопа — аминокислот, участвующих в связывании). Эти задачи можно решать экспериментальным путем, но это долго и дорого. Поэтому на помощь приходят вычислительные методы. При этом в последнее время в научном сообществе возникает все больше и больше решений, основанных на методах глубокого обучения. Один из примеров хорошо известен — Alphafold для задачи фолдинга. На семинаре будут представлен обзор существующих методов к задаче эпитопного картирования. Докладчик: Страшко Владислав.